В ЦБ для документов "Отчет о нанесении" и "Ввод в оборот" есть возможность выгрузки файлов с КМ для загрузки из в ЛК ЧЗ.
Для этого, нужно перейти в документ "Ввод в оборот", переходим в раздел "Маркировка" -> "Ввод в оборот".

Заходим в нужный документ, в табличной части товаров Еще -> Команды для технических специалистов. 

После этого становятся доступны команды:
- Выгрузить Коды маркировки - формируется файл для ЧЗ
- Подтвердить обработку документа - подтверждение, что в ЧЗ документ принят и обработан, перевод статуса марок на следующий соответствующий.